Năm 1977, một máy bay chở khách gặp nạn ở miền nam Malaysia, làm 93 hành khách và 7 thành viên phi hành đoàn thiệt mạng.
Tháng 10/2013, một phi cơ nhỏ Twin Otter, do MASwings quản lý, gặp sự cố khi đang hạ cánh xuống đảo Borneo, bang Sabah, làm phi công và một hành khách thiệt mạng.
Ngày 8/3/2014, chuyến bay 370 của Malaysia Airlines bằng máy bay Boeing 777 - 200 mang số hiệu MH370 đang bay từ Kuala Lumpur đi Bắc Kinh đã mất tích trên ra-đa của Flight Radar, cách đảo Thổ Chu, Việt Nam khoảng 300 km. Cho tới hiện nay, việc tìm thấy máy bay vẫn chưa có kết quả và nguyên nhân của vụ tai nạn vẫn còn là một bí ẩn.
